Ο θεσμός του Πανελλήνιου Συνεδρίου Φοιτητών Αρχαιολογίας ξεκίνησε από το Πανεπιστήμιο Κρήτης, το 1991. Αρχικά δεν επρόκειτο για έναν ετήσιο θεσμό αλλά υπήρχε η παράδοση το ΠΣΦΑ να φιλοξενείται από ένα διαφορετικό ίδρυμα κάθε φορά. Από το 1991 μέχρι σήμερα έχουν πραγματοποιηθεί με επιτυχία 13 Συνέδρια. Τα πρώτα δύο συνέδρια πραγματοποιήθηκαν κατά τη δεκαετία του 1990 (Πανεπιστήμιο Κρήτης, 1991 & Πανεπιστήμιο Ιωαννίνων, 1993) ενώ ο θεσμός λειτούργησε εκ νέου το 2015 με το Πανεπιστήμιο Αιγαίου.
